НА ПРИМЕРЕ ОНКОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ И САХАРНОГО ДИАБЕТА
УДК 577.2.05:612.43
Рег. № НИОКТР АААА-А21-121011490108-0
Рег. № ИКРБС
Создание Атласа транскриптомов единичных клеток эндокринных желез востребовано для разработки подходов к ранней диагностике эндокринопатий и их прогрессирующих осложнений. Результаты проведенного исследования позволили охарактеризовать транскрипотомный профиль здоровых эндокринных желез, а также опухолевые трансформации эндокринных желез на уровне единичных клеток
Был набран 231 образец от пациентов с различными патологиями органов эндокринной системы. Были исследованы новообразования мозгового и коркового слоя надпочечников, гипофиза, околощитовидной железы, щитовидной железы, поджелудочной железы, T- и B-клеточные рецепторы у пациентов с СД1. |
ПРИМЕР ИНТЕРПРЕТАЦИИ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ:
В течение 3-х лет отмечает эпизодическое повышение АД до 170/100 мм рт ст. Принимала разные комбинации антигипертензивных препаратов. В декабре 2020 г., при МСКТ ОГК выявлено объемное образование надпочечника. Проведена правосторонняя адреналэктомия.
При морфологическом и иммуногистохимическом исследовании опухоль соответствовала - феохромоцитоме.
На картинках представлены результаты scRNA-seq анализа опухоли и окружающей ткани. Была обнаружена гетерогенность тканей опухоли и изменение профиля экспрессии генов в хромафинных клетках надпочечников.
РНК-секвенировании единичных клеток осуществлялся на платформе 10x genomics, Chromium Controller
Для каждого пациента — 1000 отсеквенированных клеток после
фильтрации
Оценка средней глубины секвенирования — 50 000 прочтений на клетку
Общепринятые биоинформатические подходы и программные пакеты — Seurat и Scran
Охарактеризован транскрипционный профиль единичных клеток эндокринных опухолей
Проведен анализ изменений экспрессии генов в клетках опухолей по сравнению со здоровой референсной тканью
- Президент ЦентраДедов Иван ИвановичПрезидент Центра, Герой Труда РФ, Член Президиума РАН, академик, доктор медицинских наук, профессор, Президент Российской ассоциации эндокринологов, главный внештатный специалист-эксперт эндокринолог Министерства здравоохранения России.
- Исполняющий обязанности заместителя директора - директора НЦМУ "Национальный центр персонализированной медицины эндокринных заболеваний"Волчков Павел Юрьевичк.б.н.
- Заместитель директора Центра по научной работеМельниченко Галина АфанасьевнаАкадемик РАН, профессор, доктор медицинских наук, заведующая кафедрой эндокринологии
- Заведующий отделом хирургииБельцевич Дмитрий Германовичд.м.н.
- Заведующая отделом патоморфологииУрусова Лилия Сергеевнак.м.н.
- Врач эндокринологКрупинова Юлия Александровнак.м.н.
- Руководитель группы биобанкингаБондаренко Екатерина Владимировнак.м.н.
- Научный сотрудникУткина Марина Валерьевнак.б.н.
- Руководитель отделаПопов Сергей Владимировичк.б.н.
- Младший биоинформатикМаксимов Денис Олегович
- Лаборант-исследовательКузнецова Анна Александровна
- Лаборант-исследовательЩербакова Анастасия Сергеевна
